История ФК «Ростов» берет начало в далеком 1930 году, когда новообразованная команда носила название «Сельмашстрой». Она не принимала участия в официальных встречах, играя исключительно товарищеские матчи. В 1936 году дружина была переименована в «Сельмаш», а с 1941-го стала называться «Трактор».

Впервые команда приняла участие в первенстве РСФСР только в 1950 году. Она играла в южной зоне Азово-Донской группы. «Трактор» показывал неплохие результаты и спустя три года переведен в класс Б чемпионата СССР, где выступал уже под названием «Торпедо». Это было не последнее переименование команды. В 1957 году она получила название «Ростсельмаш», под которым выступала до начала ХХІ века.

В 1965 году дружина переместилась во вторую группу класса А. Своего лучшего результата в чемпионатах СССР «Ростсельмаш» добился в последнем розыгрыше турнира. Заняв четвертое место в первой лиге первенства Советского Союза в 1991 году, он получил право выступать в Высшей лиге уже чемпионата России. Высокие результаты команде удалось показывать не сразу. По итогам сезона-1993 команда выпала в первую лигу, через год, впрочем, вернувшись обратно.

В 1998 году «Ростсельмаш» занял и поныне рекордное для себя шестое место в Высшей лиге, получив право сыграть в Кубке Интертото. Пройдя в этом турнире македонскую «Цементарницу» и хорватский «Вартекс», клуб вышел в полуфинале на туринский «Ювентус». Приезд европейского гранда в Ростов-на-Дону вызвал большой ажиотаж болельщиков, однако даже на переполненном домашнем стадионе команда крупно уступила. В следующем сезоне ростовчане вновь играли в Кубке Интертото, где в третьем круге споткнулись о французский «Осер».

Высшим достижением команды в Кубке России является участие в финале розыгрыша 2002–2003 гг.

В 2007-м команда, уже носящая современное название ФК «Ростов», вновь покинула премьер-лигу. Выступая в следующем сезоне в первой лиге, клуб установил абсолютный рекорд по количеству матчей без поражений.

В разное время за «Ростов» играли такие известные футболисты, как Максим Бузникин, Спартак Гогниев, Дмитрий Кириченко, Дмитрий Лоськов, Юрий Ковтун, Эссау Каньенда и многие другие.

Болельщики ФК «Ростов» имеют закрепленный за ними номер 61. Официальный стадион клуба – Олимп-2, однако, согласно сайту новостей ФК «Ростов», к чемпионату-2018 в городе будет построена новая арена, рассчитанная на сорок тысяч зрителей.